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Ce prix est destiné à récompenser une équipe française ou travaillant en France ayant acquis une notoriété internationale dans le domaine des neurosciences, pour lui permettre d’accroître ses moyens d’action. Un jury scientifique, composé de personnalités représentatives de la communauté scientifique et présidé par le Professeur Yves Agid depuis septembre 2017, procède à la sélection du lauréat au vu des dossiers reçus par appel à candidatures. Ainsi le 7 juin 2017, le Professeur Jean-Yves Delattre (neurologue et directeur médical de l’Institut du Cerveau et de la Moelle à l’Hôpital de la Pitié-Salpêtrière), a été récompensé pour ses travaux de recherche sur l’apport de la génomique à la classification, la compréhension et la prise en charge des tumeurs gliales de l’adulte.
Le thème retenu pour le Prix Scientifique 2018 est « La réparation du système nerveux ».Au-delà de son Prix Scientifique annuel, la Fondation NRJ attribue également 5 subventions, de 60 000 euros chacune (50 000 euros auparavant), à de jeunes équipes œuvrant en France, récemment constituées, pour leur permettre d’acquérir des moyens d’action nécessaires à l’accomplissement de leur programme de recherche. Le thème proposé pour 2018 est "Le rôle de la microglie et de l’inflammation dans la genèse des pathologies du système nerveux". Pour sa part, NRJ Group soutient la Fondation NRJ en reversant chaque année, via sa filiale NRJ Music, 0,15 euro pour chaque exemplaire vendu de la compilation NRJ Music Awards.